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首都醫科大學圖書館始建于1960年，藏書以生物、醫藥衛生類為主。2002年新館建成后校本部圖書館館舍總面積達13980平方米，每周開放時間98小時，實行開放式借閱服務。目前校本部館藏總量84.91萬余冊（件），閱覽座位1526個，為師生提供了良好的閱讀和學習環境。圖書館在繼續增加印刷型館藏的同時，大力發展電子資源，中、外文學術性全文電子期刊逾23688 種，電子圖書131976種。已形成了以醫學文獻為主體，包括中外文圖書、期刊和報紙合訂本、音像制品以及計算機文檔等在內的多種類型、多種載體的綜合性館藏體系。